发展计算生物方法和人工智能技术研究生物分子体系的性质与功能，包括蛋白质的结构与功能，药物分子设计，蛋白设计，酶的设计、改造和定量进化，酶催化反应模拟等。
张增辉教授，1987 年毕业于美国休斯顿大学物理系，获化学物理博士学位，在加州大学伯克利分校化学系从事博士后、 助理研究员的工作，曾任纽约大学化学系助理教授，副教授， 教授，南京大学学科特区理论与计算化学研究所长，华东师范大学教授，上海纽约大学计算化学联合研究中心主任，现担任深圳理工大学（筹）讲席教授。曾获美国德瑞福斯青年教授奖，斯隆研究奖，德瑞福斯教师－学者奖，以及美国基金委颁发的总统教授奖， 国家基金委海外杰出青年学者 (B 类)，教育部第 5 批长江计划特聘讲座教授，英国皇家化学会 Fellow。目前为止在国际核心学术刊物上发表论文 400 余篇，论文引用 12,000 余次， H-index 指数 58 (web of science)，目前担任 Phys. Chem. Chem. Phys.的 Associate Editor和多个国际期刊的编委。
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论文发表节选
C.G. Ji and J.Z.H. Zhang*, “Protein Polarization Is Critical to Stabilizing AF-2 and Helix-2’Domains in Ligand Binding to PPAR gamma”, J. Am. Chem. Soc. 130, 17129–17133 (2008).
Y. Tong, C.G. Ji, Y. Mei, J.Z.H. Zhang*, “Simulation of NMR Data Reveals that Protein’s local structures Are Stabilized by Electronic Polarization”, J. Am. Chem. Soc. 131, 8636–8641 (2009).
C.G. Ji and J.Z.H. Zhang*, “Understanding the Molecular Mechanism of Enzyme Dynamics of Ribonuclease A through Protonation/Deprotonation of HIS48”, J. Am. Chem. Soc. 133, 17727-17737 (2011).
L.L. Duan, X. Liu, J.Z.H. Zhang*, “Interaction Entropy: A New Paradigm for Highly Efficient and Reliable Computation of Protein–Ligand Binding Free Energy”, J. Am. Chem. Soc., 138, 5722–5728 (2016).
Jinzhe Zeng, Liqun Cao, Mingyuan Xu, Tong Zhu*, John Z. H. Zhang*, Complex reaction processes in combustion unraveled by neural network-based molecular dynamics simulation, Nat. Comm., 11, 5713 (2020).
成果转化节选
[1] 一种表达微管β亚基与蛋白A的D结构域融合蛋白的基因工程菌株及其构建方法. ZL202010207523.9
[2] 一种基于α螺旋融合两种蛋白质且保持各自亚基活性的蛋白质融合设计方法. ZL202010192367.3
[3] 一种基于酵母二肽基肽酶Ⅲ的抗体模拟物及其应用. ZL202010192357.X