马迎飞博士/研究员/中心副主任

研究领域:微生物组、噬菌体组、噬菌体合成生物学以及应用噬菌体防治耐药菌的应用研究。

个人网站:http://isynbio.siat.ac.cn/malab

邮箱:yingfei.ma@siat.ac.cn

个人简介

马迎飞博士,博士生导师,中科院深圳先进技术研究院合成生物学研究所研究员。目前实验室主要聚焦噬菌体开展噬菌体的基础和应用研究,包括:利用高通量测序技术,开发生物信息学工具从环境和人体宏基因组数据中鉴定噬菌体序列,研究噬菌体的多样性及其在环境和人体中的功能;利用噬菌体专一杀灭细菌的特性,通过合成生物学方法设计合成人工噬菌体,应用于耐药菌感染的治疗;在国内较早的开展了在水产养殖和临床上应用噬菌体防治超级耐药菌的研究。截止目前,在国际权威刊物Cell Host Microbe(2023)、Nucleic Acids Res(2022,2023)、Nat Commun(2022)、Microbiome(2018)等以通讯作者发表论文20余篇。作为项目负责人承担国自然面上,科技部重点研发课题,深圳市团队,深圳市学科布局等各级项目。担任生物工程学会合成生物学分会委员、噬菌体技术专业委员会委员、生物物理学会肠道菌群分会委员等。


学习经历:

2005-09 至 2009-04, 中国科学院微生物研究所, 微生物, 博士

2001-09 至 2004-07, 山东农业大学, 林学院, 硕士

1997-09 至 2001-07, 山东农业大学, 林学院, 学士


工作经历:

(1)2015-9 至 今, 中国科学院深圳先进技术研究院, 副研究员、研究员

2011-05 至 2015-09, 纽约大学, 医学院, 研究科学家

2009-06至2011-04, 加州大学圣迭戈分校,博士后

 

学术成果

深圳市科技进步二等奖,深圳市,2021,排名第4.


重大科技项目承担情况

1. 国家重点研发计划“合成生物学”专项,水华蓝藻合成微生物控制系统构建与应用,2019.7-2024.6,600万,课题负责人

2. 深医专项,工程噬菌体防治难治性耐药铜绿假单胞菌感染的研究,2024.1-2026.12.300万

3. 国家自然科学基金重点项目,牙龈卟啉单胞菌通过NLRPs炎症小体途径促进结肠上皮细胞恶性转化的机制研究,2017-2021,参与

 

代表性文章

1. Min Zhao, Xin Tan#, Zi-qiang Liu, Lei Dou, Dong Liu, Yong-jun Pan, Ying-fei Ma#, Jia-lin Yu#. Engineered phage with cell-penetrating peptides for intracellular bacterial infections, mSystmes (2023)

2. Weijie Liang*,Yuqiong Yang*,  Shenhai Gong*, Mingyuan Wei*,  Yingfei Ma*,  Ruipei Feng, Jingyuan Gao,  Xiaomin Liu,  Fuyi Tu,  Wei Ma,  Xinzhu Yi,  Zhenyu Liang,  Fengyan Wang, Lingwei Wang,  Dandan Chen,  Wensheng Shu,  Bruce E Miller,  Ruth Tal-Singer,  Gavin C Donaldson, Jadwiga A Wedzicha,  Dave Singh,  Tom M A Wilkinson, Christopher E Brightling, Rongchang Chen, Nanshan Zhong, Zhang Wang.  Airway dysbiosis accelerates lung function decline in chronic obstructive pulmonary disease. Cell Host & Microbe (2023).

3. Juntao Shen, Jieqiong Zhang, Luofei Mo, Yanchen Li, Yake Li, Cun Li, Xiaoxian Kuang, Zining Tao, Zepeng Qu, Lu Wu, Junyu Chen, Shiying Liu, Linfang Zeng, Zexi He, Zuohong Chen, Yu Deng, Tong Zhang, Bing Li, Lei Dai#, Yingfei Ma#. Large-scale phage cultivation for commensal human gut bacteria. Cell Host & Microbe (2023).

4. Ran Li, Yongming Wang, Han Hu, Yan Tan & Yingfei Ma. Metagenomic analysis reveals unexplored diversity of archaeal virome in the human gut. Nat Commun (2022).

5. Shengjian Yuan, Juan Shi, Jianrong Jiang, Yingfei Ma. Genome-scale top-down reduction of phages to generate viable minimal phage genomes. Nucleic Acids Research (2022).

6. Xin Tan, Huaisheng Chen, Min Zhang, Ying Zhao, Yichun Jiang, Xueyan Liu, Wei Huang, Yingfei Ma. Clinical experience of personalized phage therapy against carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii lung infection in a patient with chronic obstructive pulmonary disease. Front Cell Infect Microbiol (2021).