戴磊研究员/所长助理/中心主任

研究领域:实验室利用合成生物学的工具,对微生物组的结构和功能进行理性设计和精准调控,致力于解决人体健康、农业生产等重大问题。

个人网站:http://www.leidailab.cn/

邮箱:lei.dai@siat.ac.cn

个人简介

戴磊,研究员,博士生导师,中国科学院深圳先进技术研究院合成所所长助理、合成微生物组学研究中心主任。国家重点研发计划青年项目首席科学家,入选《麻省理工科技评论》中国区“35岁以下科技创新35人”。实验室利用合成生物学的工具,对微生物组的结构和功能进行理性设计和精准调控,致力于解决人体健康、农业生产等重大问题。研究成果以(共同)通讯作者发表在Cell Host & Microbe、Nature Communications、The ISME Journal、ACS Synthetic Biology、iMeta等学术期刊。


学习经历:

2009-2014:美国麻省理工学院,生物物理学,博士

2005-2009:中国科学技术大学,物理学,学士


工作经历:

2018-至今:中国科学院深圳先进技术研究院,研究员

2015-2018:加州大学洛杉矶分校医学院,博士后

 

学术成果

2020-至今:编委,《合成生物学》编委会

2019-至今:理事,粤港澳肠道微生态学术联盟

2019-至今:委员,中国医药生物技术协会合成生物技术分会

2018-至今:委员,中国生物工程学会合成生物学专业委员会

审稿人:Nature Chemical Biology, PNAS, Ecology Letters, Genetics, PLOS Computational Biology, Scientific Reports,微生物学通报等学术期刊


 国际/国内或研究领域奖项

入选2019年《麻省理工科技评论》中国区“35岁以下科技创新35人”


重大科技项目承担情况

1. 国家自然科学基金面上项目,基于时序数据预测微生物群落的生态稳定性,2020.01-2023.12,58万,在研,项目负责人,项目编号:31971513

2. 国家重点研发计划“合成生物学”重点专项青年项目,治疗炎症性肠病的合成肠道菌群的构建及应用,2020 年 01 月 至 2024 年 12 月,441万,在研,项目负责人,项目编号:2019YFA09006700)

3. 国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目,植物代谢产物对根际微生物生态网络的调控,2020.10-2023.09,200万,项目编号:32061143023

4. 深圳市医学研究专项资金,肠黏膜屏障的空间微生物组学研究,2024年01月01日-2026年12月31日,300万,B2302036

 

代表性文章

1. Lu Wu#, Xu-Wen Wang#, Zining Tao, Tong Wang, Wenlong Zuo, Yu Zeng, Yang-Yu Liu# , Lei Dai* . Data-driven prediction of colonization outcomes for complex microbial communities.Nature Communications,2024.3.16.15(1):2406.

2. Shen J, Zhang J, Mo L, Li Y, Li Y, Li C, Kuang X, Tao Z, Qu Z, Wu L, Chen J, Liu S, Zeng L, He Z, Chen Z, Deng Y, Zhang T, Li B, Dai L*, Ma Y*. Large-scale phage cultivation for commensal human gut bacteria. Cell Host Microbe, 2023, 31(4):665-677.

3. Chunhua Zhou, Ying Wang, Cun Li, Zhiyong Xie*, Lei Dai*. Amelioration of colitis by a gut bacterial consortium producing anti-inflammatory secondary bile acids. Microbiology Spectrum . 2023,11(2):e0333022.  

4. Zhaohui Cao#, Wenlong Zuo#, Lanxiang Wang, Junyu Chen, Zepeng Qu, Fan Jin, Lei Dai*. Spatial profiling of microbial communities by sequential FISH with error-robust encoding  Nature Communications, 2023, 14(1):1477.

5. Lanxiang Wang*, Moxian Chen*, Pui-Ying Lam, Francisco Dini-Andreote, Lei Dai# , Zhong Wei#. Multifaceted roles of flavonoids mediating plant-microbe interactions. Microbiome, 2022,10(1):233.  

6. Han Hu#, Yuxiang Tan#, Chenhao Li#, Junyu Chen, Yan Kou, Zhenjiang Zech Xu, Yang-Yu Liu, Yan Tan* , Lei Dai*. StrainPanDA: linked reconstruction of strain composition and gene contents from metagenomic data. iMeta, 2022,1:e41.

7. Hongbin Liu#, Chen Liao#, Lu Wu, Jinhui Tang, Junyu Chen, Chaobi Lei, Linggang Zheng, Chenhong Zhang, Yang-Yu Liu, Joao Xavier, Lei Dai*. Ecological dynamics of the gut microbiome in response to dietary fiber. ISME Journal ,2022, 16(8):2040-2055. 

8. Linggang Zheng#, Yang Tan#*, Yucan Hu, Juntao Shen, Zepeng Qu, Xianbo Chen, Chun Loong Ho, Elaine Lai-Han Leung, Wei Zhao, Lei Dai*. CRISPR/Cas-based genome editing for human gut commensal Bacteroides species.ACS Synthetic Biology , 2022, 11(1):464-472.  

9. Ying Wang*, Jinhui Tang*, Qingqing Lv, Yuxiang Tan, Xiaoxiao Dong, Hongbin Liu, Nannan Zhao, Zhen He, Yan Kou, Yan Tan, Xin-an Liu, Liping Wang, Yang-Yu Liu, Lei Dai#. Establishment and resilience of transplanted gut microbiota in aged mice. iScience, 2022 25(1):103654.

10. Lei Dai#,Yushen Du#, Hangfei Qi, Christian D. Huber,Dongdong Chen, Tian-Hao Zhang, Nicholas C. Wu,Ergang Wang,James O. Lloyd-Smith, Ren Sun*. Quantifying the Evolutionary Constraints and Potential of Hepatitis C Virus NS5A Protein. mSystems, 2021, 6(2):e01111-20.  

11. YanKou, XiaominXu, ZhengnongZhu, LeiDai*, YanTan*. Microbe-set enrichment analysis facilitates functional interpretation of microbiome profiling data. Scientific Reports, 2020, 10(1):21466.

12. Tian-hao Zhang#, Lei Dai#*, John P. Barton, Yushen Du, Yuxiang Tan, Wenwen Pang, Arup K. Chakraborty, James O. Lloyd-Smith, Ren Sun*. Predominance of positive epistasis among drug resistance-associated mutations in HIV-1 protease. PLoS Genetics,2020, 16(10):e1009009.

13. YangTan, JuntaoShen, TongSi, ChunLoongHo, YinqingLi, LeiDai*. Engineered Live Biotherapeutics: Progress and Challenges. Biotechnology Journal, 2020, 15(10):e2000155.