研究领域：系统生物学，定量生物学，生物信息学。
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个人网站：zilab.org
邮箱：zk.zi@siat.ac.cn
个人简介
资治科研究员，博士生导师，国家级青年人才。课题组主要研究方向为细胞信号转导系统的调控原理与合成控制、细胞系统的数学建模和机器学习预测。目前在相关领域发表了30余篇论文，以通讯作者发表在Molecular Systems Biology、Bioinformatics、ACS Synthetic Biology、iScience等期刊上。其他参与的工作发表在Nature Biotechnolony、Nature Methods、Developmental Cell、Science Signaling、Autophagy等杂志上。
学习经历：
2005.08-2008.10德国洪堡大学博士
2002.09-2005.07清华大学硕士
1998.09-2002.06中南民族大学学士
工作经历：
2022.07-现在,中国科学院深圳先进技术研究院,研究员
2019.01-2022.06,德国联邦风险评估研究所,终身科学研究员
2014.05-2018.12,德国马克斯普朗克分子遗传所,研究员、课题组长(Group Leader, PI)
2009.11-2014.04,德国弗莱堡大学,项目组长（Project Leader）
2009.01-2009.10,德国洪堡大学,博士后
学术成就
项目承担
科技部,国家重点研发计划, 2023YFA0915701,肿瘤组织原位细胞工程化改造及应用, 2023-12至2028-11, 50万元,在研,参与。
代表性论文
（1）Liebig’s law of the minimum in the TGF-β/SMAD pathway, PLOS Computational Biology, 2024,通讯作者
（2）Machine learning unveils RNA polymerase II binding as a predictor for SMAD2‐dependent transcription dynamics in response to Actvin signalling, IET Systems Biology, 2024,通讯作者
（3）PhyloVelo enhances transcriptomic velocity field mapping using monotonically expressed genes, Nature Biotechnology, 2023,第6作者
（4）Programmable Extracellular Vesicles for Macromolecule Delivery and Genome Modifications, DEVELOPMENTAL CELL, 2020,第3作者
（5）Cell-type-specific role of CHK2 in mediating DNA damage-induced G2 cell cycle arrest, ONCOGENESIS, 2020,通讯作者
（6）Molecular Engineering of the TGF-βSignaling Pathway, JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2019,通讯作者
（7）eDetect: A Fast Error Detection and Correction Tool for Live Cell Imaging Data Analysis, ISCIENCE, 2019,通讯作者
（8）Tissue-Specific Chk1 Activation Determines Apoptosis by Regulating the Balance of p53 and p21, ISCIENCE, 2019,通讯作者
（9）Spatiotemporal Control of TGF-βSignaling with Light, ACS SYNTHETIC BIOLOGY, 2018,通讯作者
（10）Quantitative analysis of transient and sustained transforming growth factor‐βsignaling dynamics, MOLECULAR SYSTEMS BIOLOGY, 2011,通讯作者
（11）SBML-PET-MPI: a parallel parameter estimation tool for Systems Biology Markup Language based models, BIOINFORMATICS, 2011,通讯作者
（12）Time-Dependent Quantitative Multicomponent Control of the G(1)-S Network by the Stress-Activated Protein Kinase Hog1 upon Osmostress, SCIENCE SIGNALING, 2011,第2作者