马晴博士/研究员

研究领域:基因组非编码区域以及非编码RNA在干细胞分化和疾病中的功能和机理,并通过基因组的设计构建解析非编码基因组功能。

Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=DykQyyAAAAAJ&hl=en

个人网站:http://isynbio.siat.ac.cn/qingmalab/

邮箱:qing.ma@siat.ac.cn

个人简介

马晴研究员,博士生导师,国家级青年人才。北京大学生命科学学士,美国约翰霍普金斯大学细胞分子生物学博士,美国斯坦福大学医学院博士后。研究成果以第一作者发表在Developmental Cell、eLife、Development等国际专业期刊。主要科研成果:前期主要通过开发和利用遗传学、基因组学等技术方法,研究非编码RNA的生物学功能,取得了一系列重要突破。首次发现成年的体细胞干细胞性别转化现象,为生殖系统以及其他肿瘤发生提供了新机制。鉴定了多个在自闭症中作用的新的长非编码RNA,并发明了为非编码RNA进行功能分类的新方法。研究成果近五年内以第一作者或共同第一作者发表在Developmental Cell、Development、Genome Biology和Elife等国际著名杂志。其中关于干细胞性别调控的工作被Developmental Cell选为封面文章,受到了Cell,Nature Review Genetics等杂志,和Science News, AAAS, Science Daily等多家知名学术媒体报道评论。获得过约翰霍普金斯大学的Lewis奖、杰出研究生会议奖、杰出青年科学家奖和斯坦福大学院长博士后基金等多个奖项。



学习经历:


2009.08--2015.12约翰霍普金斯大学医学院生化细胞分子生物学博士研究生

2005.09--2009.07北京大学生命科学学院生物学学士


工作经历:


2022.01--至今中国科学院深圳先进技术研究院合成基因组学研究中心,研究员

2019.09--2022.01中国科学院深圳先进技术研究院合成基因组学研究中心,副研究员

2015.12--2019.09美国斯坦福大学医学院,博士后


学术成就


项目承担

1.科技部,重点研发合成生物学专项青年项目,人体微生物组非编码RNA功能元件的解析与改造合成的平台技术,2022.10-2027.10,在研,主持;

2.国家自然科学基金委,面上项目,干细胞性别转换开关Chinmo的非编码调控研究,2021.01至2024.12,在研,主持;

3.广东省基金委,面上项目,干细胞性别转换开关Chinmo的非编码致病突变和调控研究,2021.01至2023.12,在研,主持。


代表性文章

Ma Q*#, Yang L*, Tolentino K*, Wang G, Zhao Y, Lizenburger UM, Shi Q, Zhu L, Yang C, Jiao H, Zhang F, Li R, Tsai M, Chen J, Lai L, Zeng H, Li L#, Chang HY#. Inducible lncRNA transgenic mice reveal continual role of HOTAIR in promoting breast cancer metastasis. eLife, 2022, 11: e79126. doi: 10.7554/eLife.79126

Li J*, Ming Z*, Yang L*, Wang T, Liu G, Ma Q#. Long noncoding RNA XIST: Mechanisms for X chromosome inactivation, roles in sex-biased diseases, and therapeutic opportunities. Genes & Diseases, 2022, 9(6): 1478-1492. doi: 10.1016/j.gendis.2022.04.007

Wang T, Li J, Yang L, Wu M, Ma Q#. The Role of Long Non-coding RNAs in Human Imprinting Disorders: Prospective Therapeutic Targets. Front Cell Dev Biol, 2021, 9:730014. doi: 10.3389/fcell.2021.730014.

Lu Z#, Guo JK, Wei Y, Dou DR, Zarnegar B, Ma Q, Li R, Zhao Y, Liu F, Choudhry H, Khavari PA, Chang HY#. Structural modularity of the XIST ribonucleoprotein complex. Nat Commun, 2020, 11(1):6163. doi: 10.1038/s41467-020-20040-3.

Fang J*, Ma Q*, Chu C, Huang B, Li L, Cai P, Batista PJ, Tolentino KEM, Xu J, Li R, Du P, Qu K# & Chang HY#. PIRCh-seq: functional classification of non-coding RNAs associated with distinct histone modifications. Genome Biology, 2019, 20(1), 1-21. doi: 10.1186/s13059-019-1880-3.

Ang CE*, Ma Q*, Wapinski O*, Fan S, Flynn R, Coe B, Onoguchi M, Do B, Dukes-Rimsky L, Xu J, Lee Q, Wang L, Eichler E, Penninger J, Eichler EE, Srivastava A, Wernig M#, Chang HY#. The novel lncRNA lnc-NR2F1 is pro-neurogenic and mutated in human neurodevelopmental disorders. Elife, 2019, 8:e41770 doi: 10.7554/eLife.41770

Zhang W*, Zhang X*, Xue Z*, Li Y*, Ma Q, Ren X, Zhang J, Yang S, Yang L, Wu M, Ren M, Xi R, Wu Z, Liu J, Matunis E, Dai J#, Gao G#.Probing the function of metazoan histones with a systematic library of H3 and H4 mutants. Developmental Cell, 2019, 48: 1-14. doi: 10.1016/j.devcel.2018.11.047.

Ma Q, Chang HY. Single-cell profiling of lncRNAs in the developing human brain. Genome Biology, 2016, 17(1):68. doi: 10.1186/s13059-016-0933-0.

Ma Q, de Cuevas M, Matunis E. Chinmo is sufficient to induce male fate in somatic cells of the adult Drosophila ovary. Development, 2016, 143(5):754-63. doi: 10.1242/dev.129627

Ma Q, Wawersik M, Matunis E. The Jak-STAT target Chinmo prevents sex transformation of adult stem cells in the Drosophila testis niche. Developmental Cell, 2014, 31: 474-486. (Cover article, highlighted by Nature Review Genetics, Developmental Cell and Biology of Reproduction.)

Li Y, Ma Q, Cherry CM, Matunis E. Steroid signaling promotes stem cell maintenance in the Drosophila Testis. Developmental Biology, 2014, 394: 129-141. doi: 10.1016/j.ydbio.2014.07.016