研究领域：表观基因组信息的遗传机制以及肿瘤发生和耐药性产生的表观遗传调控机制。
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个人网站：http://isynbio.siat.ac.cn/ganlab/
邮箱：hy.gan@siat.ac.cn
个人简介
甘海云研究员，博士生导师，国家级青年人才。2011年在中国科学院动物研究所获得博士学位，之后先后在美国Mayo Clinic以及哥伦比亚大学进行博士后研究，回国前是美国ST JUDE儿童研究医院细胞分子生物学部门生物信息负责人。课题组主要研究方向为利用系统生物学、合成生物学以“干湿”实验结合的模式研究表观基因组信息的传递机制以及其在肿瘤发生和耐药性产生、全能性细胞(2C)、细胞衰老、染色体外DNAecDNA)、合成表观重构、DNA复制起始分子复合物、人工细胞等的表观遗传调控机制。已在表观基因组领域取得了一系列重要的成果，近五年来研究成果发表在Science、Nature Medicine、Nature Genetics、Molecular Cell、Nature CommunicationsGenes & Development、PNAS、eLife、The EMBO Journal、Nucleic Acids Research等知名期刊，累计引用超过3400次。
学习经历：
2007.09-2011.07中国科学院发育生物学博士
2004.09-2007.07东北农业大学微生物学硕士
2000.09-2004.07东北农业大学生物科学理科基地班学士
工作经历：
2019.09-至今中国科学院深圳先进技术研究院，研究员
2018.04-2019.07美国圣裘德儿童研究医院（St. Jude Children Research Hospital），生物信息研究科学家（Bioinformatics Research Scientist）
2016.08-2018.04美国哥伦比亚大学（Columbia University），副研究员（Associate Research Scientist）
2012.10-2016.07美国梅奥医院（Mayo Clinic），博士后（Research Fellow）
2011.07-2012.09中国科学院动物研究所，助理研究员
学术成就
会议报告
The 11th international symposium on DNA Damage Response＆Human Disease (isDDRHD-2020)，The histone segregation onto replicating DNA strands during DNA replication，特邀报告2020；
第十二届全国生物信息学与系统生物学学术大会，表观信息的遗传记忆与细胞命运决定，一般报告，2023；
第十三届中国模式真菌研讨会DNA复制压力下，前导链和后随链的耦合机制，特邀报告，2021；
中国细胞生物学学会2024年全国学术大会，亲代组蛋白回收机制与细胞命运决定，一般报告，2024；
第六届全国生物化学与分子生物学会基础医学青年论坛，组蛋白遗传受损促进肿瘤进展，特邀报告，2023。
编委情况
中国细胞生物学学会染色质生物学分会，2023-01-2026-12，委员。
项目承担
国家重点研发计划，科技部，2019YFA0903803，基于人工染色体疾病动物模型构建，主持，2020-01-2024-12；
国家自然科学基金面上项目，国家自然科学基金委，32070610，MCM2、POLE3调控亲代组蛋白传递的分子机制和生物学功能，主持，2021-01-2024-12；
国家自然科学基金重大项目，国家自然科学基金委，32090031，真核细胞DNA复制起始及复制叉里的生化反应机制，参与，2021-01-2025-12；
广东省自然科学基金杰出青年项目，广东省自然科学基金委，2021B1515020109，肿瘤耐药的表观遗传机制和新型抗肿瘤策略的研发，主持，2021-01-2024-12；
深圳市医学研究专项资金资助项目前沿探索型一般项目，深圳市医学研究专项资金管理委员会，B2302049，表观信息的精准遗传延缓衰老的机制与应用研究，主持，2024-01-2026-12。
部分代表性文章
1. Tian C, Zhang Q, Jia J, et al. DNA polymerase delta governs parental histone transfer to DNA replication lagging strand[J].Proceedings of the National Academy of Sciences, 2024, 121(20): e2400610121.
2.Karri S, Yang Y, Zhou J, et al. Defective transfer of parental histone decreases frequency of homologous recombination by increasing free histone pools in budding yeast[J].Nucleic Acids Research, 2024: gkae205.
3. Qing Wen#, Jiaqi Zhou#, Congcong Tian#, Xinran Li#, Guibing Song#,Yuan Gao, Yaping Sun, Chiyuan Ma, Sitong Yao, Xiaoyan Liang, Xing Kang, Nan Wang, Yuan Yao, Hongbao Wang, Xiaohuan Liang, Jialin Tang, Steven M. Offer, Xiaohua Lei, Chuanhe Yu, Xiangyu Liu, Zichuan Liu, Zhiquan Wang, and Haiyun Gan*, ‘Symmetric inheritance of parental histones contributes to safeguarding the fate of mouse embryonic stem cells during differentiation’Nature Genetics.（2023）
4. Congcong Tian#, Jiaqi Zhou#, Xinran Li#, Yuan Gao, Qing Wen, Xing Kang, Nan Wang, Yuan Yao, Jiuhang Jiang, Guibing Song, Tianjun Zhang, Suili Hu, JingYi Liao, Chuanhe Yu, Zhiquan Wang, Xiangyu Liu, Xin-hai Pei, Kuiming Chan, Zichuan Liu & Haiyun Gan*. "Impaired histone inheritance promotes tumor progression"Nature Communications. (2023)
5. Yao Y#, Wen Q#, Zhang T, Yu C, Chan KM, Gan H*. "Advances in Approaches to Study Chromatin-Mediated Epigenetic Memory". ACS Synth Biol. doi: 10.1021/acssynbio.1c00394. (2021)
6. Albert Serra-Cardona, Chuanhe Yue , Xinmin Zhang , Xu Hua, Yuan Yao , Jiaqi Zhou , Haiyun Gan*, and Zhiguo Zhang*, "A mechanism for Rad53 to couple leading- and lagging-strand DNA synthesis under replication stress in budding yeast."PNAS, 118: e2109334118. (2021)
7. Xinran Li#,Jiaqi Zhou#, Wenjuan Zhao#, Qing Wen#, Weijie Wang, Huipai Peng, Yuan Gao, Kelly J. Bouchonville, Steven M. Offer, Kuiming Chan, Zhiquan Wang*, Nan Li*, Haiyun Gan*."Defining proximity proteomics of histone modifications by antibody-mediated protein A-APEX2 labeling"Genomics, Proteomics & Bioinformatics.(2021)
8. Q.Wen#, Y. Yao#, X. Li, Z. Hu, H. Mei, H. Gan*. "Chromatin replication and parental histone allocation. "Genome Instability & Disease. 2:51–58 (2021)
9. Yu, C#, H. Gan#, A. Serra-Cardona, L. Zhang, S. Gan, S. Sharma, E. Johansson, A. Chabes, R. M. Xu and Z. Zhang. "A mechanism for preventing asymmetric histone segregation onto replicating DNA strands".Science361, 1386-1389 (2018). (Highlighted in Science and F1000)
10. Li, S., Z. Xu, J. Xu, L. Zuo, C. Yu, P. Zheng, H. Gan, X. Wang, L. Li and S. Sharma. "Rtt105 functions as a chaperone for replication protein A to preserve genome stability."The EMBO journal: e99154 (2018).
11. H. Gan#, A. Serra-Cardona#, X. Hua, H. Zhou, K. Labib, C. Yu and Z. Zhang. The Mcm2-Ctf4-Polα Axis Facilitates Parental Histone H3-H4 Transfer to Lagging Strands.Mol Cell72(1): 140-151 e143 (2018).
12. Fang, D#, H. Gan#, L. Cheng, J. H. Lee, H. Zhou, J. N. Sarkaria, D. J. Daniels and Z. Zhang. H3.3K27M mutant proteins reprogram epigenome by sequestering the PRC2 complex to poised enhancers.ELife, 7 (2018).
13. H. Gan#, C. Yu#, S. Devbhandari, S. Sharma, J. Han, A. Chabes, D. Remus and Z. Zhang*, Checkpoint kinase Rad53 couples leading and lagging strand DNA synthesis under replication stress.Mol Cell68, 446-455 e443 (2017). (Highlighted in Cell Cycle)
14.Zhang, H#, H. Gan#, Z. Wang#, J. H. Lee, H. Zhou, T. Ordog, M. S. Wold, M. Ljungman and Z. Zhang*. RPA Interacts with HIRA and Regulates H3.3 Deposition at Gene Regulatory Elements in Mammalian Cells.Mol Cell, 65(2):272-284 (2017). (Highlighted in F1000)
15. Fang, D#, H. Gan#, J. H. Lee#, J. Han#, Z. Wang#, S. M. Riester, L. Jin, J. Chen, H.Zhou, J. Wang, H. Zhang, N. Yang, E. W. Bradley, T. H. Ho, B. P. Rubin, J. A. Bridge, S. N. Thibodeau, T. Ordog, Y. Chen, A. J. van Wijnen, A. M. Oliveira, R. M. Xu, J. J.Westendorf and Z. Zhang*, The histone H3.3K36M mutation reprograms the epigenome of chondroblastomas.Science352, 1344-1348 (2016). (Highlighted in F1000)